阿罗土登班觉寺是第七世大宝法王曲札嘉措于公元1471年，藏历铁兔年所创建的。公元1700年，著名的第八世大司徒仁波切确吉迥乃出生在该寺附近的一个村家中，当时德格土司就赐予大司徒仁波切——阿罗土登班觉寺，大司徒仁波切主持该寺佛法达数年。公元1727年，大司徒仁波切建立阿罗土登班觉寺的分寺，即今天闻名于世的八蚌寺。
第十一世大司徒仁波切为了弘扬佛法，将阿罗土登班觉寺赐给噶玛土登仁波切由其担任住持。他一生弘扬佛法，利益众生。
目前，该寺住持根绒多吉仁波切是萨迦法王和大司徒仁波切法意相通后认定为噶玛土登仁波切的转世活佛，并被赐予阿罗土登班觉寺担任住持。
